Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms