Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PSMB9P28065 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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