Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT1P26358 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms