Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms