Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RD3LP0DJH9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms