Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1AO95602 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms