Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPXO76031 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLPXO76031 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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