Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVV-2B6SEH9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms