Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms