Protein–RNA interactions for Protein: A6NER0

TBC1D3F, TBC1 domain family member 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3FA6NER0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBC1D3FA6NER0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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