Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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