Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SH3BP4Q9P0V3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SH3BP4Q9P0V3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SH3BP4Q9P0V3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SH3BP4Q9P0V3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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