Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PECRQ9BY49 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PECRQ9BY49 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms