Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms