Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms