Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKD2Q969F2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms