Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM41Q8WV44 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM41Q8WV44 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms