Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HJURPQ8NCD3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms