Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS8Q8N3P4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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