Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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