Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms