Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATL3Q6DD88 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms