Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEF1DP3Q658K8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1DP3Q658K8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms