Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms