Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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KCNT1Q5JUK3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNT1Q5JUK3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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