Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ALFQ53S48 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms