Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms