Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC18A3Q16572 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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