Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms