Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms