Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.026e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 COMT-201ENST00000207636 1319 ntTSL 514.37□□□□□ -0.116e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.116e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 MAZ-204ENST00000561855 672 ntTSL 514.21□□□□□ -0.135e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 TEX2-210ENST00000615733 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.63e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 TEX2-204ENST00000583097 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.63e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 TEX2-208ENST00000584379 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.693e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 TEX2-201ENST00000258991 5232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.843e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.066e-13■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.46e-13■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 UCP2-208ENST00000544615 1004 ntTSL 29.48□□□□□ -0.896e-13■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.53e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 C19orf48-216ENST00000641834 1718 nt17.39■□□□□ 0.373e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.133e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 C19orf48-203ENST00000593287 578 ntTSL 513.37□□□□□ -0.273e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 C19orf48-209ENST00000597705 892 ntTSL 311.93□□□□□ -0.53e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 C19orf48-208ENST00000597493 971 ntTSL 211.71□□□□□ -0.533e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 C19orf48-213ENST00000601267 782 ntTSL 211.54□□□□□ -0.563e-6■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.149e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.61e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 CAPRIN2-211ENST00000540584 569 ntTSL 420.73■□□□□ 0.912e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 CAPRIN2-212ENST00000541765 630 ntTSL 520.73■□□□□ 0.912e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 CAPRIN2-210ENST00000540436 557 ntTSL 319.78■□□□□ 0.762e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 CAPRIN2-207ENST00000537108 2187 ntTSL 56.92□□□□□ -1.32e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.211e-30■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 FBXO7-204ENST00000425028 1921 ntTSL 520.39■□□□□ 0.851e-30■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-30■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 FBXO7-203ENST00000420700 1900 ntTSL 517.13■□□□□ 0.331e-30■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 BGLAP-202ENST00000471413 931 ntTSL 516.55■□□□□ 0.243e-13■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.343e-13■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 CRTC2-205ENST00000467860 573 ntTSL 310.59□□□□□ -0.713e-13■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 FBXO7-209ENST00000492535 6884 ntTSL 57.7□□□□□ -1.181e-30■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.321e-30■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 CRTC2-209ENST00000493909 207 ntTSL 20.74□□□□□ -2.293e-13■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 TRAPPC1-207ENST00000575639 561 ntTSL 214.24□□□□□ -0.138e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.463e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 LTBP3-218ENST00000530866 3756 ntTSL 212.3□□□□□ -0.448e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 SDC2-205ENST00000520233 563 ntTSL 417.22■□□□□ 0.357e-17■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 SDC2-203ENST00000519587 557 ntTSL 413.66□□□□□ -0.227e-17■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 ALG13-213ENST00000482374 679 ntTSL 214.61□□□□□ -0.071e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 ALG13-207ENST00000468657 916 ntTSL 214.58□□□□□ -0.081e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 ALG13-220ENST00000489033 785 ntTSL 312.8□□□□□ -0.361e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.371e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 ALG13-226ENST00000622986 582 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.081e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 ALG13-222ENST00000492038 1098 ntTSL 37.74□□□□□ -1.171e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.231e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.291e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 ACSL3-203ENST00000407441 538 ntTSL 35.97□□□□□ -1.451e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 ACSL3-208ENST00000495541 749 ntTSL 24.99□□□□□ -1.611e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.631e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.761e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 ALG13-231ENST00000623255 585 ntTSL 33.83□□□□□ -1.81e-11■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.412e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-7■■■□□ 17.7
PCBP2Q15366 PCCA-204ENST00000413170 397 ntTSL 311.97□□□□□ -0.492e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 PCCA-208ENST00000458283 669 ntTSL 39.93□□□□□ -0.822e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 SEZ6L2-203ENST00000350527 3173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.571e-10■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 SEZ6L2-202ENST00000346932 3015 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.71e-10■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 SEZ6L2-204ENST00000537485 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.791e-10■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 SEZ6L2-209ENST00000617533 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.811e-10■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.014e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 NDUFV2-208ENST00000577703 854 ntTSL 321.33■■□□□ 1.014e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.484e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 NDUFV2-209ENST00000583375 211 ntTSL 515.05■□□□□ -04e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.254e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.575e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.45e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 DCTN2-208ENST00000547480 599 ntTSL 215.37■□□□□ 0.053e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 DCTN2-217ENST00000550750 567 ntTSL 214.25□□□□□ -0.133e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 DCTN2-215ENST00000550201 1527 ntTSL 512.52□□□□□ -0.43e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 DCTN2-221ENST00000551400 568 ntTSL 312.3□□□□□ -0.443e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 DCTN2-201ENST00000434715 1677 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.523e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 DCTN2-212ENST00000549394 1439 ntTSL 211.1□□□□□ -0.633e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 DCTN2-209ENST00000548249 2061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.83e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 DCTN2-202ENST00000543672 1321 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.973e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 DCTN2-218ENST00000550954 892 ntTSL 58.59□□□□□ -1.033e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 DCTN2-206ENST00000546965 542 ntTSL 46.91□□□□□ -1.33e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 DCTN2-207ENST00000547345 566 ntTSL 26.74□□□□□ -1.333e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 DCTN2-204ENST00000546670 580 ntTSL 35.68□□□□□ -1.53e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 SMAD5-209ENST00000514777 588 ntTSL 312.05□□□□□ -0.489e-7■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.429e-7■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.699e-7■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.614e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 SMAD7-202ENST00000545051 2211 ntTSL 214.17□□□□□ -0.144e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 SH3GL1-203ENST00000593591 1036 ntTSL 413.22□□□□□ -0.295e-7■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 SH3GL1-204ENST00000598219 619 ntTSL 37.63□□□□□ -1.195e-7■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 GPR108-211ENST00000597706 1834 ntTSL 520.34■□□□□ 0.852e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.822e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 GPR108-208ENST00000595908 1750 ntTSL 517.72■□□□□ 0.432e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 GPR108-213ENST00000598626 619 ntTSL 314.19□□□□□ -0.142e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 GPR108-203ENST00000537722 619 ntTSL 1 (best)13.7□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 GPR108-205ENST00000594500 523 ntTSL 313.7□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 GPR108-204ENST00000594034 778 ntTSL 311.48□□□□□ -0.572e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 PCGF3-212ENST00000488032 263 ntTSL 44.43□□□□□ -1.74e-6■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 INTS6-213ENST00000486195 555 ntTSL 423.06■■□□□ 1.287e-8■■■□□ 17.6
PCBP2Q15366 INTS6-217ENST00000491723 713 ntTSL 518.13■□□□□ 0.497e-8■■■□□ 17.6
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