Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms