Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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RAB35Q15286 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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RAB35Q15286 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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RAB35Q15286 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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RAB35Q15286 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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RAB35Q15286 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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