Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms