Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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