Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms