Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms