Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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