Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms