Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms