Protein–RNA interactions for Protein: P29475

NOS1, Nitric oxide synthase, brain, humanhuman

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOS1P29475 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOS1P29475 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOS1P29475 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOS1P29475 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NOS1P29475 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOS1P29475 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms