Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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