Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGB4P16144 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms