Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD46P15529 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD46P15529 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD46P15529 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms