Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRPRAP08240 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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