Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms