Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DGG1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms