Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms