Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms