Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms